Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPAP53621 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPAP53621 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPAP53621 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPAP53621 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
COPAP53621 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPAP53621 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPAP53621 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPAP53621 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPAP53621 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPAP53621 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPAP53621 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPAP53621 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPAP53621 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPAP53621 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPAP53621 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPAP53621 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPAP53621 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms