Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SRP9P49458 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRP9P49458 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRP9P49458 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRP9P49458 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRP9P49458 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms