Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRPPRCP42704 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRPPRCP42704 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms