Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNB1P35222 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms