Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF4P34130 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF4P34130 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF4P34130 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF4P34130 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF4P34130 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF4P34130 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF4P34130 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF4P34130 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF4P34130 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF4P34130 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF4P34130 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF4P34130 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF4P34130 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF4P34130 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF4P34130 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms