Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCKARP32238 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCKARP32238 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCKARP32238 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKARP32238 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKARP32238 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms