Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms