Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTSSP25774 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSSP25774 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSSP25774 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms