Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPREP23469 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPREP23469 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPREP23469 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPREP23469 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPREP23469 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPREP23469 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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