Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRDP23468 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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