Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRBP23467 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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