Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USF1P22415 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USF1P22415 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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