Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2P22307 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2P22307 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2P22307 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2P22307 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2P22307 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2P22307 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2P22307 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2P22307 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2P22307 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2P22307 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2P22307 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2P22307 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2P22307 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2P22307 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2P22307 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2P22307 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms