Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRHP20396 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRHP20396 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRHP20396 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRHP20396 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRHP20396 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRHP20396 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRHP20396 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRHP20396 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRHP20396 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRHP20396 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRHP20396 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRHP20396 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TRHP20396 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRHP20396 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRHP20396 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRHP20396 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRHP20396 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms