Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms