Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLK3P07288 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLK3P07288 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
KLK3P07288 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLK3P07288 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms