Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG7O95352 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG7O95352 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATG7O95352 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATG7O95352 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATG7O95352 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATG7O95352 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG7O95352 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG7O95352 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG7O95352 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATG7O95352 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATG7O95352 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms