Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG12O94817 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG12O94817 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms