Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms