Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PITX3O75364 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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PITX3O75364 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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PITX3O75364 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PITX3O75364 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PITX3O75364 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX3O75364 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PITX3O75364 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PITX3O75364 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PITX3O75364 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PITX3O75364 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PITX3O75364 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PITX3O75364 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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