Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG13O75143 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG13O75143 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG13O75143 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG13O75143 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG13O75143 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG13O75143 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG13O75143 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms