Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms