Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGR3O43761 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms