Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CRXO43186 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CRXO43186 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CRXO43186 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms