Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGSM2O43147 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms