Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3CA6NKF2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms