Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L4A6NCW7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms