Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSDA5PKW4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms