Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf170A2RU37 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms