Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPDC1A2A3K4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms