Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1C4

TRBV27, T-cell receptor beta variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV27A0A0K0K1C4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms