Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUBP2Q9Y5Y2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms