Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HECTD4Q9Y4D8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HECTD4Q9Y4D8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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