Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXND1Q9Y4D7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXND1Q9Y4D7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms