Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK2Q9UPX8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK2Q9UPX8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms