Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND2AQ9ULE3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms