Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms