Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA2Q9UL42 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA2Q9UL42 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms