Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PFDN2Q9UHV9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN2Q9UHV9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms