Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPAR3Q9UBY5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms