Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK4Q9UBT3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms