Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms