Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF2Q9NX18 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF2Q9NX18 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms