Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms