Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDREJQ9NTG1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms