Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms