Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG3Q9NT62 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms