Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB6BQ9NRW1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms