Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX15Q9NRS6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX15Q9NRS6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms