Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM8Q9NQV8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms